この特例の適用を受けた場合は、譲渡を行った居住用の資産の譲渡益にかかわる課税が将来に繰り延べられます。ただし、非課税になるわけではありません。
このことから、譲渡したマイホームの取得価額は買い換えたマイホームに引き継がれることになります。この買い換えのマイホームを将来譲渡した場合の譲渡所得からの取得価額は、その買い換えのマイホームの実際の購入価額ではなく、譲渡をした元のマイホームから引き継がれた取得価額になるのです。
具体的には以下の通りになります。
１）売却額＝買い換え額
売却額が５千万円で、譲渡にかかった費用は１００万円、売却したマイホームの取得価額は３千万円、買い換えたマイホームの購入額は５千万円（建物が１５００万円で土地は３５００万円）で、引き継がれる取得価額は売却取得価額に譲渡の費用を足した３１００万円となります。
この場合の取得価額の土地・建物への分配は以下のようになります。
土地：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝２１７０万円
建物：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝９３０万円
２）売却額＞買い換え額
売却額が５千万円で、譲渡にかかった費用は１００万円、売却したマイホームの取得価額は３千万円、買い換えたマイホームの購入額は６千万円（建物が４２００万円で土地は１８００万円）で、引き継がれる取得価額は、（売却取得価額＋譲渡の費用）＋（買い替えの購入額－売却額）＝４１００万円となります。
この場合の取得価額の土地・建物への分配は以下のようになります。
土地：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝２８７０万円
建物：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝１２３０万円
３）売却額＜買い換え額
売却額が５千万円で、譲渡にかかった費用は１００万円、売却したマイホームの取得価額は３千万円、買い換えたマイホームの購入額は４千万円（建物が２５００万円で土地は１５００万円）で、引き継がれる取得価額は、（売却取得価額＋譲渡の費用）X買い替えの購入額／売却額＝２４８０万円となります。
この場合の取得価額の土地・建物への分配は以下のようになります。
土地：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝１５５０万円
建物：引き継がれる取得価額X土地の買い換え購入額／買い換えたマイホームの購入額＝９３０万円